ΠΡΟΣ ΤΟΝ ΕΠΙΤΗΡΗΤΗ – Το ξέσπασμα της πανδημίας της νόσου του κοροναϊού 2019 (COVID-19) λόγω του σοβαρού οξέος αναπνευστικού συνδρόμου coronavirus 2 (SARS-CoV-2) κηρύχθηκε πανδημία στις 12 Μαρτίου 2020 από τον Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας [ 1 ].

Ένα σημαντικό ζήτημα που σχετίζεται με το ξέσπασμα ήταν η συσχέτιση του ιικού φορτίου RNA που ελήφθη μετά από αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης αντίστροφης μεταγραφής (RT-PCR) και εκφράστηκε ως κατώφλι κύκλου (Ct) με μεταδοτικότητα και ως εκ τούτου διάρκεια εξόδου από τις επαφές και απόρριψη από εξειδικευμένο μολυσματικό θάλαμοι ασθένειας.

Αρκετές πρόσφατες δημοσιεύσεις, βασισμένες σε περισσότερες από 100 μελέτες, προσπάθησαν να προτείνουν μια τιμή Ct και τη διάρκεια της εξώθησης, με συναίνεση περίπου Ct> 30 και τουλάχιστον 10 ημέρες, αντίστοιχα [ 2–5 ].

Ωστόσο, σε ένα άρθρο που δημοσιεύθηκε στοΚλινικές μολυσματικές ασθένειες , οι Bullard et al ανέφεραν ότι οι ασθενείς δεν μπορούσαν να μεταδοθούν με Ct> 25 καθώς ο ιός δεν ανιχνεύθηκε σε καλλιέργεια πάνω από αυτήν την τιμή [ 6 ].

Αυτό το όριο στη συνέχεια αναφέρθηκε στα γαλλικά μέσα ενημέρωσης κατά τη διάρκεια συνέντευξης με ένα μέλος του Γαλλικού Επιστημονικού Συμβουλίου Covid-19 ως πιθανή τιμή πάνω από την οποία οι ασθενείς δεν είναι πλέον μεταδοτικοί [ 7 ].

Στην αρχή της επιδημίας, συσχετίσαμε τις τιμές Ct που ελήφθησαν χρησιμοποιώντας την τεχνική PCR με βάση την ενίσχυση του γονιδίου Ε και τα αποτελέσματα της καλλιέργειας [ 8 ].

Από την αρχή της πανδημίας, έχουμε πραγματοποιήσει 250 566 SARS-CoV-2 RT-PCR για 179 151 ασθενείς, εκ των οποίων 13 161 (7,3%) θετικά.

Μέχρι το τέλος Μαΐου, 3790 από αυτά τα δείγματα, που αναφέρθηκαν ως θετικά σε ρινοφαρυγγικά δείγματα, εμβολιάστηκαν και αντιμετωπίστηκαν για καλλιέργεια όπως περιγράφηκε προηγουμένως [ 8].

Από αυτά τα 3790 εμβολιασμένα δείγματα, 1941 προϊόντα απομόνωσης SARS-CoV-2 μπορούσαν να ληφθούν μετά τον πρώτο εμβολιασμό ή έως και 2 τυφλές υποκαλλιέργειες.

Η συσχέτιση μεταξύ των τιμών του σαρωτή και της θετικότητας της κουλτούρας μας επιτρέπει να παρατηρήσουμε ότι η εικόνα που λαμβάνεται με 10 φορές περισσότερες απομονώσεις από ό, τι στην προκαταρκτική μας εργασία (1941 έναντι 129) δεν αλλάζει σημαντικά ( Σχήμα 1 ).

Μπορεί να παρατηρηθεί ότι σε Ct = 25, έως 70% των ασθενών παραμένουν θετικοί στην καλλιέργεια και ότι σε Ct = 30 αυτή η τιμή μειώνεται στο 20%. Στο Ct = 35, η τιμή που χρησιμοποιήσαμε για να αναφέρουμε ένα θετικό αποτέλεσμα για PCR, <3% των καλλιεργειών είναι θετικές.

Η τιμή Ct μας 35, αρχικά βασίστηκε στα αποτελέσματα που ελήφθησαν από το RT-PCR σε αρνητικά δείγματα ελέγχου στο εργαστήριό μας και τα αρχικά αποτελέσματα καλλιεργειών [ 8], επικυρώνεται από τα αποτελέσματα που παρουσιάζονται εδώ και συσχετίζεται με αυτό που προτάθηκε στην Κορέα [ 9 ] και στην Ταϊβάν [ 10 ].

Θα μπορούσαμε να παρατηρήσουμε ότι οι υποκαλλιέργειες, ειδικά η πρώτη, επιτρέπουν ένα αυξανόμενο ποσοστό απομόνωσης ιού σε δείγματα με τιμές Ct, επιβεβαιώνοντας ότι αυτές οι υψηλές τιμές Ct συσχετίζονται κυρίως με χαμηλά ιικά φορτία.

Από την κοόρτη μας, πρέπει τώρα να προσπαθήσουμε να κατανοήσουμε και να καθορίσουμε τη διάρκεια και τη συχνότητα της απόρριψης ζωντανών ιών σε ασθενείς κατά περίπτωση, στις σπάνιες περιπτώσεις όταν η PCR είναι θετική μετά από 10 ημέρες, συχνά σε Ct> 30 .

Σε κάθε περίπτωση, αυτές οι σπάνιες περιπτώσεις δεν πρέπει να επηρεάζουν τις αποφάσεις για τη δημόσια υγεία.

Φιγούρα 1.

 

Ποσοστό θετικών ιογενών καλλιεργειών σοβαρού οξέος αναπνευστικού συνδρόμου αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης κοροναϊού 2 – θετικών ρινοφαρυγγικών δειγμάτων από ασθενείς με νόσο κοροναϊού 2019, σύμφωνα με την τιμή Ct (απλή γραμμή).

Η διακεκομμένη καμπύλη υποδεικνύει την καμπύλη πολυωνυμικής παλινδρόμησης. Συντομογραφίες: Ct, κατώφλι κύκλου; Πολυ., Πολυώνυμο.

Σημειώσεις

Ηθική έγκριση. Το πρωτόκολλο εγκρίθηκε από την ηθική επιτροπή μόλυνσης του Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Méditerranée. Όλοι οι ασθενείς παρείχαν ενημερωμένη συγκατάθεση σύμφωνα με τη Διακήρυξη του Ελσίνκι.

Οικονομική υποστήριξη. Αυτή η έρευνα χρηματοδοτήθηκε από τη γαλλική κυβέρνηση στο πλαίσιο του προγράμματος Investissements d’avenir (Investments for the Future) που διαχειρίζεται το Agence Nationale de la Recherche (Γαλλική Εθνική Υπηρεσία για την Έρευνα · αναφορά: Méditerranée Infection 10-IAHU-03) και από το Région Provence -Alpes-Côte d’Azur και ευρωπαϊκή χρηματοδότηση Fond Europen de Recheche et de developmentpement (FEDER) PRIMI.

Πιθανές συγκρούσεις συμφερόντων. Ο DR αναφέρει επιχορηγήσεις από την Hitachi High-Tech Corporation εκτός του υποβληθέντος έργου. Όλοι οι άλλοι συγγραφείς δεν αναφέρουν πιθανές συγκρούσεις. Όλοι οι συγγραφείς έχουν υποβάλει τη φόρμα ICMJE για αποκάλυψη πιθανών συγκρούσεων συμφερόντων. Έχουν αποκαλυφθεί συγκρούσεις που θεωρούν οι συντάκτες σχετικές με το περιεχόμενο του χειρόγραφου.